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2011年3月22日，中国中医科学院中药研究所与首都医科大学在中药所举行了“北京市校外人才培养基地”揭牌暨合作协议续签仪式，中药所所领导及导师代表、研究生院宋春生常务副院长、首都医科大学校领导及中医药学院领导等40余人参加。

签约仪式由朱晓新副所长主持，边宝林副所长和线福华副校长为“北京市校外人才培养基地”揭牌；周兴书记与马谊平副书记代表双方续签了框架合作协议；朱晓新副所长与车念聪院长共同签订了研究生培养等合作协议；中医药学院王秀娟书记和车念聪院长分别介绍了“基地”的建设、教育与教学、科研等方面合作的内容和取得的成果；黄璐琦副院长兼中药所所长介绍了中药所的发展概况和学科优势，表达了对双方深入合作的信心，特别强调了双方在中药学研究生培养及中药学博士点的建设等方面加强合作，优势互补；首都医科大学李明书记和吕兆丰校长也对双方的合作模式和取得的成果给予了肯定，希望双方资源共享，在人才培养、学科建设方面进行更深入的合作，取得共赢，并祝愿在今后5年的合作中取得更多更好的成绩和成果。

首都医科大学一行还参观了中药所设在和平里的“人才培养基地”，包括GLP中心、药理实验室、动物房、中药制剂中试车间等。

中药所与首医大在2007年签署了合作框架协议，以此为契机，开展了一系列合作。为了提升首医大中药学的师资力量和教学、科研实力，中药所选派了10名学术骨干担任首医大的研究生导师，每年培养中药学研究生10人。于此同时，双方在科学研究、人才培养基地建设等方面开展了卓有成效的合作，2010年，获得北京市教委的“北京市校外人才培养基地”授牌。双方合作为探索中央驻京单位与北京市属院校合作模式，实现优势互补，提供了有益的尝试。